ANII | Agencia Nacional de Investigación e Innovación

El objetivo principal de investigación del grupo del Dr. Carlos Rovira en la Universidad de Lund es contribuir a una mejor comprensión del papel de los ARN no codificantes en el desarrollo del cáncer. Para ello utilizan una estrategia interdisciplinaria, combinando el trabajo experimental de laboratorio con la bioinformática. Han desarrollado una amplia experiencia en métodos de secuenciación masiva y en el análisis de los datos generados por estos métodos. Uno de los proyectos actuales del grupo tiene como objetivo analizar las consecuencias de la desregulación de PDCD4 en tumores que sobreexpresan miR-4728, uno microARN que se encuentra codificado en un intrón de HER2. La sobreexpresión de miR-4728 conduce a la represión de la expresión de PDCD4, un gen supresor de tumores, en tumores HER2 positivos. Dado que PDCD4 se une al factor de iniciación eucariota 4A que inhibe el inicio de la traducción CAP dependiente y que se ha reportado recientemente que factores eIF4 pueden inducir cáncer, el grupo del Dr. Rovira realizó experimentos de Ribosome Profiling para rastrear cambios a nivel de la traducción después de alterar la expresión de miR-4728-3p. Es en este contexto que surge mi interés en realizar una capacitación con el grupo del Dr.Rovira en el análisis de datos de Ribosome Profiling para extender mis capacidades en el análisis de datos de NGS. Desde 2008 formo parte de la Unidad de Bioinfomática del Institut Pasteur de Montevideo donde desarrollo tareas técnicas y de investigación principalmente a través del análisis de datos de NGS y de microarrays. En particular me he dedicado al análisis de datos de expresión, tanto de ARN mensajeros como de pequeños ARNs en distintos sistemas y contextos. Este entrenamiento me permitiría ampliar los análisis de expresión y consecuentemente mayor profundidad en la comprensión de la regulación de la expresión génica.