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El bovino Criollo Uruguayo (BCU), descendiente directo del ganado introducido por los conquistadores europeos, constituye un recurso genético de inestimable valor. Estudios en el BCU y en otros bovinos Criollos americanos dan cuenta de su gran potencial productivo. El Departamento de Genética y Mejora Animal de Facultad de Veterinaria, junto con otros Departamentos de la misma Facultad, ha estudiado el mayor rodeo conocido, en Rocha, desde diversos aspectos. El hallazgo reciente de otro rodeo más pequeño en Cerro Largo aumenta las posibilidades de manejo poblacional para la conservación de la raza como recurso genético ganadero y su potencial desarrollo comercial en nuestro país. Con el proyecto FMV_1_2019_1_156176 "Genotipado de alta densidad en bovinos Criollo Uruguayo como herramienta para el manejo genético de los rodeos", dentro del cual se enmarca el presente proyecto de tesis, se pretende incorporar al manejo poblacional de los rodeos el genotipado masivo de marcadores polimórficos de nucleótido simple (SNP), con los objetivos de generar un perfil genómico de la raza que nos permita llevar a cabo un manejo reproductivo y genético racional y a largo plazo.

El Bovino Criollo Uruguayo es una raza bovina con gran diversidad genética, emparentado con razas criollas de Argentina y Brasil. Hasta hace unos años existían aproximadamente unos 600 animales ubicados en dos poblaciones: la reserva de San Miguel (N = 525) y un productor privado en Cerro Largo (Establecimiento San Joaquín, N = 62). Estudios previos con marcadores moleculares polimórficos se han centrado en la población de San Miguel y han encontrado baja introgresión genética, alta heterocigosidad y valores de endogamia cercanos a cero, con un leve déficit de homocigotas. No han habido muestreos recientes, y hasta el momento no hay estudios con marcadores del tipo SNP. El objetivo de este trabajo fue caracterizar las poblaciones desde una perspectiva genético-poblacional mediante un chip de genotipado de SNP de mediana densidad. Los resultados muestran que la raza bovina Criollo Uruguayo es una raza taurina constituida, sin introgresión de Bos indicus y sin introgresión de razas taurinas comerciales presentes en el país. Las poblaciones tienen gran variabilidad genética, evidenciada en su alta heterocigosis, relativamente alto tamaño efectivo poblacional y baja endogamia. En tanto la población de San Miguel se ha mantenido en aislamiento reproductivo y con alto grado de pureza, la población de San Joaquín presentó cierto grado de introgresión de razas comerciales, principalmente con Hereford. Si bien el nivel de variabilidad genética es medio a alto y la endogamia es baja, por su pequeño tamaño poblacional la raza se encontraría en peligro de extinción, y se incentiva a continuar los esfuerzos de caracterización, manejo y conservación de la raza. El genotipado masivo de densidad media resultó ser una herramienta efectiva para la evaluación de las poblaciones de Criollo Uruguayo analizadas.